Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 AC026785.3-201ENST00000511182 285 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
USP35Q9P2H5 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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USP35Q9P2H5 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 AKAP5-201ENST00000320636 2601 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 CRBN-201ENST00000231948 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 CNPY1-202ENST00000406197 560 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
USP35Q9P2H5 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
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