Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018521.2-202ENST00000582142 473 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012510.1-201ENST00000607946 759 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPL7A-202ENST00000323345 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MRPS33-202ENST00000393008 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LSAMP-AS1-201ENST00000490351 553 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093895.1-201ENST00000506480 821 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM30C-201ENST00000561158 410 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-204ENST00000587129 841 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC008734.1-201ENST00000594006 537 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 DAPL1-204ENST00000621326 671 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CTNNBIP1Q9NSA3 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms