Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC126323.5-201ENST00000569913 592 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 E2F6P1-201ENST00000428850 745 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 E2F6P3-201ENST00000441743 743 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RN7SL372P-201ENST00000461982 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 OR7E19P-202ENST00000589942 844 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 KYNUP2-201ENST00000582280 1329 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FAM3AP98173 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms