Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 BACH1-IT2-201ENST00000436529 806 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SCDP1-201ENST00000455244 1081 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SUMO2P19-201ENST00000518920 295 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 HRG-201ENST00000232003 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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RTL8BQ17RB0 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL096869.1-201ENST00000557622 559 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 Z98949.1-213ENST00000608921 856 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC005355.2-201ENST00000625064 484 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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