Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
AP3M2P53677 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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AP3M2P53677 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 PRR9-201ENST00000368744 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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AP3M2P53677 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
AP3M2P53677 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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