Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC012488.1-201ENST00000611221 640 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.39-201ENST00000614194 271 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC239803.3-201ENST00000614663 494 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC105339.4-201ENST00000624471 737 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 STK32A-209ENST00000626951 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PFKM-232ENST00000629846 381 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SPANXN2-201ENST00000598475 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LARP7-201ENST00000324052 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC133552.3-201ENST00000572236 1869 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ESRRG-221ENST00000493603 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SOCS5P5-201ENST00000402732 1586 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SYTL2-228ENST00000533892 1441 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNA5SP218-201ENST00000363188 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IFNA16-201ENST00000380216 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 MIR654-201ENST00000385199 81 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SUMO2P13-201ENST00000403109 272 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 BMS1P12-201ENST00000428213 706 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL122003.1-201ENST00000435206 784 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC091808.1-201ENST00000438867 786 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 C15orf40-202ENST00000451195 518 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL395P-201ENST00000462960 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 RN7SL635P-201ENST00000492123 296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 PFN2-217ENST00000498307 556 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC113404.1-201ENST00000502589 756 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 TPT1P5-201ENST00000511433 521 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC027801.3-201ENST00000515049 698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 CRYAB-215ENST00000533971 981 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 AP003721.2-201ENST00000536495 452 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LINC02443-201ENST00000536518 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
VPREB1P12018 LRTOMT-212ENST00000536917 579 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms