Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 TGFB3-AS1-201ENST00000553732 580 ntTSL 4 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC010618.3-203ENST00000595116 313 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF98-205ENST00000601553 566 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP194-201ENST00000411328 351 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL158070.1-201ENST00000421614 631 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 EIF4A1P5-201ENST00000428062 1095 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL591438.2-201ENST00000452635 691 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC02530-201ENST00000457945 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC139451.1-201ENST00000463176 330 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3OR16-15-201ENST00000565463 414 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 PCBP1-AS1-244ENST00000594376 1197 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL356052.1-201ENST00000605764 376 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 MIR6880-201ENST00000622851 62 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SMIM11B-203ENST00000622934 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 MRPS31-201ENST00000323563 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 PIK3C3-204ENST00000586545 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 IYD-207ENST00000425615 684 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC006333.1-204ENST00000429396 648 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 CC2D2A-207ENST00000507954 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
HMGB1P1B2RPK0 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms