Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 IL5RA-209ENST00000446632 2514 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
CCDC96Q2M329 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 NEDD8-203ENST00000524927 653 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC024145.1-201ENST00000535324 775 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
CCDC96Q2M329 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms