Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC004039.1-201ENST00000431165 502 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC105384.1-201ENST00000512405 835 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CALB1-208ENST00000518457 1490 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
RTL8BQ17RB0 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms