Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TRAF5-202ENST00000336184 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CACNA2D3-212ENST00000620722 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CYCSP17-201ENST00000407870 315 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 NFIA-AS2-203ENST00000438559 1275 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL157871.4-201ENST00000557226 385 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 IMPA1-202ENST00000311489 1106 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EFNB3Q15768 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms