Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UEVLD-205ENST00000396197 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IL22-201ENST00000328087 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CEP41-203ENST00000343969 1087 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TRAV8-3-201ENST00000390435 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IYD-205ENST00000392256 882 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 REG3G-203ENST00000409471 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC092167.1-201ENST00000435466 495 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC007365.1-201ENST00000439964 627 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 CYP2C56P-201ENST00000440076 291 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC016396.1-201ENST00000440189 328 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC092687.2-201ENST00000452909 568 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 RN7SL332P-201ENST00000482163 254 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC111000.1-201ENST00000514545 713 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 AL135934.1-201ENST00000527684 537 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 TIMM9-205ENST00000555404 430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 TRIM69-210ENST00000561043 1017 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC099524.1-206ENST00000568131 407 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 INTS6-AS1-218ENST00000598905 906 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 TSHZ2-201ENST00000329613 3093 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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PDCD1Q15116 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PDCD1Q15116 BDNF-209ENST00000420794 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 NF1P8-201ENST00000415351 1461 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC018688.1-201ENST00000636528 1754 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PDCD1Q15116 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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