Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC109454.2-201ENST00000503470 520 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PVT1-214ENST00000522875 922 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MSL3-206ENST00000380693 2377 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF568-215ENST00000617745 2441 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MBD5-201ENST00000404807 5920 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL354794.2-201ENST00000424795 1248 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 OR2T35-202ENST00000641268 2957 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 IL1B-201ENST00000263341 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 CD163-202ENST00000396620 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
HOXD10P28358 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms