Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms