Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GGA2Q9UJY4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
GGA2Q9UJY4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms