Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2IRD1Q9UHL9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2IRD1Q9UHL9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms