Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL28Q9NXS3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms