Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
POLR3EQ9NVU0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms