Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MEPEQ9NQ76 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms