Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EHD4Q9H223 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms