Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB11FIP5Q9BXF6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms