Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYD88Q99836 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MYD88Q99836 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms