Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC38A2Q96QD8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC38A2Q96QD8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms