Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCC12Q96J65 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCC12Q96J65 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms