Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MTERF3Q96E29 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms