Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HELBQ8NG08 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELBQ8NG08 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms