Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2LQ8IYA6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2LQ8IYA6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms