Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST3Q7LGC8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST3Q7LGC8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms