Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ANKRD54Q6NXT1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ANKRD54Q6NXT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms