Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CELF3Q5SZQ8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CELF3Q5SZQ8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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