Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR44Q5JSH3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms