Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC027348.2-201ENST00000624375 642 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
FOXD1Q16676 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
FOXD1Q16676 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
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