Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM25Q14258 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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