Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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