Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
NUCB1Q02818 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NUCB1Q02818 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms