Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HDLBPQ00341 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDLBPQ00341 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms