Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SSBP2P81877 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms