Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPAP53621 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPAP53621 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPAP53621 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPAP53621 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPAP53621 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms