Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HMGB2P26583 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGB2P26583 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms