Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARF4P18085 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARF4P18085 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARF4P18085 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARF4P18085 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARF4P18085 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARF4P18085 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms