Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM6P0DI80 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM6P0DI80 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms