Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNQ3O43525 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNQ3O43525 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms