Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HTRA2O43464 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HTRA2O43464 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms