Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD3A6NKT7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD3A6NKT7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms