Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC015923.1-202ENST00000581421 491 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
USP35Q9P2H5 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.3 ms