Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CUZD1-206ENST00000392790 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC22A10-201ENST00000332793 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 CD101-202ENST00000369470 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SPTBN1Q01082 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 LINC00536-201ENST00000505156 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RBM41-202ENST00000372487 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 MRPS5P4-201ENST00000592830 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL390882.1-201ENST00000618821 594 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AL353763.2-201ENST00000623489 1903 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 INTS7-202ENST00000366993 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 SIPA1L1-202ENST00000381232 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SPTBN1Q01082 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms