Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 HAVCR2-201ENST00000307851 2907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CCDC125-203ENST00000396499 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF844-202ENST00000441304 2036 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC096582.3-201ENST00000636578 3716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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