Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC01098-201ENST00000507870 1034 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF706-212ENST00000520984 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MYL1-201ENST00000341685 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MCTS1-202ENST00000371317 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL136084.2-214ENST00000587726 716 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC073857.1-201ENST00000625082 1054 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CIR1-201ENST00000342016 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 GAPDHP57-201ENST00000424400 585 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
AP5B1Q2VPB7 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms