Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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TCOF1Q13428 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
TCOF1Q13428 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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