Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HLA-DMAP28067 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PHF11-201ENST00000357596 1471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 U3.1-201ENST00000362500 215 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 C1QTNF9B-203ENST00000382145 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 FAUP2-201ENST00000394301 401 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 HIST1H2BPS2-201ENST00000402707 340 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 APCDD1L-AS1-204ENST00000427794 461 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC018541.1-201ENST00000517706 764 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 OR5M6P-201ENST00000530227 937 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL161747.2-201ENST00000535893 472 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC090971.3-201ENST00000557871 1041 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 EIF4A3P1-201ENST00000578499 647 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 IL13-206ENST00000617259 498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC012560.1-201ENST00000634930 459 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 FGL2-202ENST00000637771 989 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 OR5E1P-201ENST00000305754 927 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 TCTE3-201ENST00000366774 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC114812.2-201ENST00000439336 663 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 ZNF138-205ENST00000440155 1066 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HLA-DMAP28067 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms