Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OR7E24-201ENST00000456448 1550 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FETUB-202ENST00000382134 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ARF1P1-201ENST00000406466 544 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP154-201ENST00000410136 290 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC006547.2-201ENST00000412713 526 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL772284.1-201ENST00000443421 905 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BUB3P1-201ENST00000458451 999 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092943.1-201ENST00000485389 878 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL569P-201ENST00000494652 288 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC093821.1-201ENST00000503950 539 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC108073.1-201ENST00000508231 674 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SNCA-211ENST00000508895 905 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM6-211ENST00000515022 1060 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MED30-204ENST00000522839 476 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC087286.4-201ENST00000558757 746 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FRG2HP-201ENST00000568807 832 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC007221.1-201ENST00000570038 796 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC009716.1-201ENST00000583287 398 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK2-211ENST00000591142 875 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CD209-211ENST00000602261 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SNCA-212ENST00000611107 297 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.71-201ENST00000612122 282 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3191-201ENST00000636300 76 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD5-218ENST00000545552 3471 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DBIL5P2-202ENST00000491724 1692 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 POGZ-201ENST00000271715 6626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL359220.1-202ENST00000500036 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 PAAF1-202ENST00000376384 1500 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37A11P-202ENST00000579258 3717 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 BCO2-201ENST00000357685 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00920-201ENST00000499966 2147 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNF146-210ENST00000608991 2169 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 HMBOX1-211ENST00000524238 1731 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 DYDC2-207ENST00000616870 1723 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 IGHV1-24-201ENST00000390610 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL137784.1-201ENST00000407121 745 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP136-201ENST00000410927 300 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A5P2-201ENST00000413713 897 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
TIMMDC1Q9NPL8 AL359475.1-201ENST00000414505 292 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
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